В разные годы работы парка среди его единомышленников были видные российские и зарубежные ученые: профессор, доктор биологических наук С.Н. Дроздов, профессор кафедры ботаники Университета г. Хельсинки Р. Руухиярви, главный научный сотрудник Института озероведения РАН, доктор биологических наук Л.А. Кудерский, профессор Санкт-Петербургского университета экономики и финансов, доктор географических наук В.М. Разумовский, зам. председателя Президиума КарНЦ РАН, доктор геолого-минералогических наук, член-корреспондент РАЕН В.С. Куликов, ведущий научный сотрудник Института Геологии КарНЦ РАН, доктор геолого-минералогических наук В.В. Куликова.
В настоящее время отдел мониторинга парка всесторонне поддерживают и оказывают помощь сотрудники Карельского научного центра РАН и Петрозаводского государственного университета: ведущий научный сотрудник Института леса КарНЦ РАН, кандидат биологических наук А.В. Полевой, ведущий научный сотрудник Института леса КарНЦ РАН, кандидат биологических наук А.Э. Хумала, ученый секретарь, старший научный сотрудник Института леса КарНЦ РАН, кандидат биологических наук О.О. Предтеченская, старший научный сотрудник Института леса КарНЦ РАН, кандидат биологических наук А.В. Руоколайнен, старший научный сотрудник Института леса КарНЦ РАН, кандидат сельскохозяйственных наук А.Н. Пеккоев, ведущий научный сотрудник Института леса КарНЦ РАН, кандидат биологических наук А.В. Кравченко, научный сотрудник Института леса, кандидат биологических наук В.В. Тимофеева, ведущий научный сотрудник Института биологии КарНЦ РАН, доктор биологических наук И.А. Барышев, старший научный сотрудник Института геологии, кандидат геолого-минералогических наук Н.С. Нестерова, главный научный сотрудник Института геологии, доктор геолого-минералогических наук С.А. Светов, доцент ПетрГУ, доктор биологических наук А.В. Сонина.
Помимо вышеобозначенных организаций, парк сотрудничает в рамках подписанных соглашений с рядом других учреждений: ФГБУ «Национальный парк «Кенозерский», ФГБУ «Объединенная дирекция государственного природного биосферного заповедника «Костомукшский» и национального парка «Калевальский», ФГБУ «Национальный парк «Паанаярви», ФГБУ «Государственный природный заповедник «Пасвик», КФ ФГБНУ «Всероссийский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии», ФГБУ «ВНИИКР», ФГАОУ ВО «Северный (Арктический) федеральный университет имени М.В. Ломоносова», ГБУ РК «Республиканский центр по охране объектов культурного наследия» и др. Результатом сотрудничества становятся научные экспедиции, участие в проводимых сторонами конференциях, обмен опытом научной работы.