Историческая деревня Канзанаволок находится на открытой южной оконечности большого острова, обозначенного на разных географических картах как Канзанаволок («Семейный мыс») или Коскосалма («Пролив у подсек»). Оба названия возникли не ранее эпохи Средневековья. Впервые однодворная деревня на Канзине-наволоке вместе с жившим в ней крестьянином Игнашкой Микифоровым упоминается в писцовой книге 1563 г. При русском царе Иване IV это поселение оказалось в составе «Государевой опричнины»: его упоминает «Список с Сотной грамоты Водлозерской волости» (1570 г.) как Канзанаволок на Водле ж озере. Письменные источники по истории Канзанаволока в составе Каргопольского уезда в конце XVI–XVIII вв., в настоящее время неизвестны. По водлозерскому преданию, записанному известным этнографом Н. Н. Харузиным, в Смутное время местные жители разбили многочисленный враждебный отряд из казаков и «литовских людей» в непосредственной близости от деревни на поляне, позднее называвшейся Боевым полем. При составлении Переписной окладной книги 1725 г. в Канзанаволоке были зафиксированы 22 души мужского пола. В течение XVIII – XIX вв. население деревни постепенно увеличивалось. К 1873 г. в ней стояли 24 дома, в них проживали 145 мужчин и женщин. В начале ХХ в. Канзанаволок являлся самым многолюдным поселением на Водлозере (200 человек в 33 дворах, а также 17 ссыльных) и центром Канзанаволоцкого сельского общества. Здесь работали продуктовая лавка, казенный винный магазин («казенка»), биллиардная. С XVIII в. в деревне возвышается красивая часовня во имя Воздвижения Креста Господня (часовенный праздник отмечался 27 сентября по новому стилю; заветный праздник деревни – в день Смоленской иконы Божьей Матери 9 июля по новому стилю). Вокруг деревни до середины острова простирались ее обширные сенокосные и лесные угодья. На границе с земельным участком соседнего гнездового поселения Коскосалма, при дороге, стоял Половинный крест и старая сосна, обращенная в «метное дерево».

В советский период Канзанаволок – центр одноименного сельсовета, объединявшего 18 деревень. Наибольшей численности его население достигло к 1933 г., когда в нем проживал 221 человек. В 1989 г. в деревне числилось 7 постоянных жителей. В 1998 г. умер последний дворохозяин Елисеев. Канзанаволок превратился в летнее дачное поселение. В бывшей усадьбе Елисеева создан частный музей, где представлен традиционный быт водлозеров. Среди экспонатов – сшитая по старинной технологии еловыми корнями лодка. В Канзанаволоке до наших дней сохранился жилой дом Н. И. Гоголева (постройка начала ХХ в.) – памятник архитектуры муниципального значения. В августе 2016 г. в Канзанаволке по инициативе его уроженцев и их потомков был установлен памятный знак, посвященный родной деревне, со списком фамилий всех его жителей.